育才三小创办于2002年9月，学校地处蛇口自贸区和蛇口网谷的核心地带，占地面积10001.5㎡，其中建筑面积7860㎡。现有专任教师75人，其中具有硕士学位11名，本科学历64名，高级教师5人，广东省名教师工作室主持人1人，市区名师工作室主持人3人。学校常年聘请外教一名。
学校设备设施配备齐全，按广东省一级学校标准配置，现有多功能教室、图书室、阅览室、舞蹈室、综合实践活动室、小型会议室、工会活动室各一间，科技室、美术室、电脑室、音乐教室各两间，200米运动场一个，五层楼教工单身宿舍一栋，教工食堂一个。2002年9月至2004年8月隶属于育才一小，时名育才一小花园部。2003年更名为深圳市蛇口育才教育集团育才三小，2004年9月正式独立办学，隶属于深圳市蛇口育才教育集团。
建校以来，学校一直坚持本着 以人为本，各美其美 的办学理念，十年坚持进行 小学开展国际理解教育的行动研究 的课题研究，通过公民教育、意趣课堂文化、校本课程、社团活动、阳光体育、校园文化、师资提高、联合促进、制度建设、网络技术十大工程的研究，协调发展学生综合素质和个性特长，培养学生具有人文与科学素养，创新精神、实践能力与合作意识，具有民族精神和国际视野， 建学生喜欢的课堂，办家长满意的教育 ,走内涵式发展的办学之路，形成了鲜明的国际理解教育办学特色,为学生掌握21世纪的关键能力打下坚实基础。
学校先后获得全国少先队辅导员专业化建设实验学校，全国中小学棋类教学课题研究实验基地 ,广东省中小学心理健康教育示范学校，广东省义务教育规范学校，广东省首批红领巾示范校，深圳市教育先进单位，深圳市依法治校示范校，深圳市绿色学校，深圳市书香校园，深圳市南山区体育特色项目学校（足球），南山区教育先进单位，南山区德育十佳学校，南山区科技特色学校，深圳市首届示范教研组等荣誉和奖励。
